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酸、碱降解法．酸、碱降解法利用无机或有机酸、碱等破坏灵芝孢子细胞壁中几丁质、纤维素等成分的结构，使其有效成分易于溶出．使用无机酸或有机酸溶液热处理灵芝孢子提取灵芝多糖，后多糖中分子量在2000~4900Da的部分均在60%以上.物理法物理法的工作原理各异，优缺点也不相同，总体来说，物理法的能量消耗较大，且设备较为复杂、投资较大．低温冷冻法．低温冷冻法利用灵芝孢子中的水分在低温条件下结晶、结晶长大等作用破坏灵芝孢子细胞壁．例如，金刚阴在实验中将灵芝抱子在-20T反复冻融，其破壁率高达99.5%．超声波法．
《宋史》中写到及至南宋庆元五年八月，“太室西北夹室楹生白芝四叶，前史以白芝为丧祥”，似乎像被命运安排好一样“明年八月，国连有大丧”。灵芝在早期文献记载中的明确考证第1个是从《神农本草经》考证。《神农本草经》是中国现存部完整的药物学著作，它集合了很多医学著作，创作于公元前，总结了汉代以前的所有的药物学知识。第2个是《神农本草经》中将灵芝分为上、中、下三种，《神农本草经》中记载的上品灵芝多达120种，长时间服用能够使身体轻盈，血气充足，进而达到，而中品也有120种，能够治疗疾病，补气养血。下品有125种，能够去除寒气，疏络筋脉，可以作为辅药。总计记载的灵芝有365种。其中上品的灵芝中有不少学名：赤芝、黑芝、青芝、白芝、黄芝、紫芝。《神农本草经》中还对上述的6种灵芝进行了详细描述。与当代的各类医学著作进行比较，我们可以清楚地发现，《神农本草经》对灵芝的药物性质、主要治疗的疾病的描述，相差不大。这与魏朝和晋朝之后的医药专家以严谨的态度看待被神化的芝草有关。其中这6种灵芝的药效在现代医学验证下也已经得到了很明确的验证。因此，所载六芝的药效被古今药物学家不断地验证，《神农本草经》中的六芝与现代医学中的灵芝很相近。
超声波法主要利用超声的空机械振动和空化效应来破坏灵芝抱子细胞壁.例如，Alzorqi等利用超声波提取P-D-葡聚糖,在优化条件下p-D-葡聚糖的产量为5.228mg/g．微波法．微波法利用微波的穿透能力和热效应，使细胞内部的温度迅速上升，从而使细胞内部的压力超过细胞壁膨胀所能承受的压力而破碎，促使其有效成分释放．例如，先将灵芝抱子进行微波处理，而后在低温深加工，灵芝抱子的破壁率可达99%以上．超临界提取法．超临界提取法利用气体在超临界状态下的性质,即流体的性质，使有效成分被流体萃取,Li等M运用超临界CO2萃取技术提取灵芝抱子，萃取率达到37%．机械法机械法的优点是操作简单、易行;缺点是机械设备投资大、运行成本较高．
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防治措施针对芝棒污染原因和引发途径，生产上，要掌握灵芝品种的特征特性，提供适宜其生长的环境条件，规范操作，并贯彻为主的方针，避免或减少芝棒感染杂菌。选用优良品种，对退化品种进行提纯复壮选用抗病性强、生活力强、高纯度的菌种进行接种。经多年试验示范，以采收子实体为主的菌株“日本赤灵芝”，采芝、收粉兼用型菌株“黄山8号”两个优良菌株较适宜我省气候特点及段木熟料灵芝栽培模式，由于栽培多年，该两个品种有退化趋势，需进行提纯复壮。科学安排栽培季节根据中原地区气候特点，短段木灵芝菌棒制作期选在11月上旬至翌年2月上旬为宜，在此时段内，为让菌丝有足够的发菌时间，宜利用当地气候资源，提早制作菌棒。
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